Le PARCC : lauréat de l’appel à projets SESAME

Lauréate de l’appel d’offre SESAME, la plate-forme d’histologie et d’imagerie in situ du PARCC, ayant pour responsable scientifique le Professeur Cécile Badoual obtient un financement de la Région Île-de-France pour l’acquisition d’un nouveau scanner de lame haut débit. La plate-forme devient ainsi la seule en France à disposer d’un équipement de pointe aussi complet pour une meilleure connaissance des mécanismes cellulaires et moléculaires d’adaptation des vaisseaux du cœur et des reins à leur environnement normal et pathologique, mais aussi des cellules tumorales dans différents modèles.

Lame scannée de rein de souris dans un modèle de hyalinose segmentaire et focale induite par l’intoxications aux glucocorticoides.

En pathologie vasculaire et métabolique ou en pathologie tumorale, des progrès majeurs sont apparus dans la prise en charge des patients. Ces progrès ont été possibles, entre autres, grâce au développement de biomarqueurs prédictifs de réponse aux traitements. Ainsi, depuis quelques années, il est apparu essentiel de développer les marquages et leur lecture des différentes populations cellulaires. Le développement de nouvelles techniques d’imagerie et de marquages multiples, place l’histologie au cœur de la compréhension des mécanismes physiopathologiques. L’exploration in situ des tissus connait aujourd’hui un véritable essor numérique et technologique.

Premières en France à avoir fait l’acquisition de deux microscopes spectraux Vectra puis Polaris-PerkinEmler® et à développer les marquages multiparamétriques, les équipes du Centre de Recherche Cardiovasculaire de Paris (PARCC), dirigé par Alain Tedgui, puis Chantal Boulanger, ont aujourd’hui une expertise d’explorations multiplexes du microenvironnement, nationalement et internationalement reconnue. Pour autant, ces techniques n’étant pas dédiées à la génération à haut débit de lames virtuelles, la plate-forme souhaitait pouvoir disposer d’un outil simplifiant l’acquisition des données sur de grandes séries de modèles animaux et des cohortes de patients, afin de produire un nombre de lames virtuelles compatibles avec des études à compétitivité nationale et internationale et répondant aux besoin de développement et d’application d’algorithmes de deep learning.

Le nouveau scanner de lame haut débit sera au cœur de la plateforme d’histologie et d’imagerie in situ du PARCC dédiée au déploiement, à l’optimisation et à l’automatisation des études histologiques. 

Les lames virtuelles de coupes histologiques offrent de nombreux avantages scientifiques en favorisant un travail collaboratif particulièrement intéressant pour les possibilités d’examen, d’annotation, de confrontation des interprétations que la technique autorise. La qualité des images obtenues permet quant à elle d’effectuer des mesures histologiques qualitatives et quantitatives sur la coupe entière. Particulièrement ergonomique, cet outil a l’avantage de traiter de façon automatisée et rapide, de grands volumes de données en association avec les données cliniques.

L’ensemble des équipements et des compétences associées permettra à la plate-forme d’offrir un service complet et unique au sein d’Université Paris Cité, apportant un soutien essentiel à la recherche fondamentale et au développement clinique en vue d’une médecine personnalisée.

LE PARCC

Le centre de recherche cardiovasculaire de Paris (PARCC, Inserm UMR970) est composé de 13 équipes labellisées et rassemble plus de 320 personnels chercheurs, administratifs et techniciens. Le PARCC a une forte expertise en biologie vasculaire cardio-vasculaire, rénale et tumorale, à la fois fondamentale et translationnelle. La plateforme d’histologie est codirigée par Mme Corinne Lessaffre, le Dr Olivia Lenoir et le Pr Cécile Badoual.

Cécile Badoual

PU-PH-chef de service anatomo-pathologie HEGP, Université Paris Cité. Responsable scientifique de la plate-forme d’histologie et d’imagerie in situ du PARCC.

Chantal Boulanger

Directrice de recherche Inserm. Directeur du Centre de Recherche Cardiovasculaire de Paris, Inserm UMR-970.